Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD9Q3L8U1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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