Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CCDC96Q2M329 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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