Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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