Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ZIC1Q15915 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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ZIC1Q15915 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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ZIC1Q15915 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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