Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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