Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SIX1Q15475 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SIX1Q15475 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SIX1Q15475 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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SIX1Q15475 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SIX1Q15475 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SIX1Q15475 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SIX1Q15475 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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