Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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