Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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