Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGRF1Q13972 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms