Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms