Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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