Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms