Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTK7Q13308 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms