Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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