Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FOXF2Q12947 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FOXF2Q12947 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FOXF2Q12947 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FOXF2Q12947 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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