Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms