Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms