Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ID3Q02535 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ID3Q02535 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms