Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF17Q02223 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms