Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms