Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFI35P80217 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFI35P80217 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFI35P80217 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms