Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRX1P78414 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRX1P78414 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRX1P78414 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRX1P78414 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRX1P78414 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms