Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms