Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms