Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms