Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms