Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PGGT1BP53609 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PGGT1BP53609 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PGGT1BP53609 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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