Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ME1P48163 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms