Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABIFP47224 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABIFP47224 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms