Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms