Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA3P35244 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms