Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms