Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA2P29317 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms