Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IL3RAP26951 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms