Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PTPRBP23467 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PTPRBP23467 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PTPRBP23467 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PTPRBP23467 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PTPRBP23467 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRBP23467 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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