Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ME2P23368 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ME2P23368 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms