Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDSP20132 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDSP20132 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDSP20132 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDSP20132 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDSP20132 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDSP20132 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDSP20132 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDSP20132 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDSP20132 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDSP20132 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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