Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFP17480 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFP17480 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBTFP17480 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBTFP17480 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBTFP17480 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBTFP17480 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBTFP17480 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBTFP17480 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBTFP17480 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms