Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms