Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRG2P13727 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRG2P13727 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms