Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms