Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms