Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms