Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBSLP0DN79 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms