Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms