Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms