Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms