Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms