Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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