Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRRTM2O43300 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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